AI蛋白质设计平台公司「分子之心」近日完成数亿元A轮融资，由谢诺投资、深创投联合领投，商汤国香资本、久奕投资跟投。本轮融资将用于进一步扩大复合型人才团队，深入完善AI蛋白质基础大模型、AI蛋白质优化设计平台MoleculeOS等技术平台，加速AI蛋白质技术的产业落地和商业化进程。
据悉，这已是分子之心在过去两年多里获得的第三轮融资。过往投资方包括合成生物学龙头企业凯赛生物、红杉中国、百度BV、联想创投等。
分子之心成立于2022年1月，由知名计算生物学家许锦波创立，团队成员均来自全球知名科研机构、跨国药企、AI公司、合成生物学公司，兼具AI生物交叉背景和跨领域产业经验。公司目前已自研十余项性能业界领先的AI蛋白质预测、优化、设计算法。
一站式AI蛋白质预测、优化与设计平台MoleculeOS是分子之心的核心技术平台，通过运用AI方法，该平台能够帮助生物工作者快速发现、改造、甚至从头设计具备特定功能的蛋白质，加速实验室成果的产业转化。目前已被用于多肽、抗体、酶和小蛋白等各类型蛋白质的研究和设计。
借助自研产业级AI蛋白质生成大模型NewOrigin（达尔文），MoleculeOS的能力正在不断提升。
分子之心推出的一站式AI蛋白质预测、优化与设计平台MoleculeOS；受访公司供图
作为集成序列、结构、功能和进化的产业级AI蛋白质生成大模型，NewOrigin具备高效的、功能驱动的蛋白质生成能力。“可针对产业应用需求在几小时内、甚至是分钟级‘定制’具有特定功能的蛋白质”，谈及NewOrigin的优势，分子之心向36氪表示，该大模型具有成功率高、普适性强、使用门槛低的特点，能够大幅降低湿实验筛选、验证的成本，提升蛋白质优化和从头设计的效率和成功率。
分子之心告诉36氪，NewOrigin已在大分子药物设计、极端环境下蛋白质稳定性优化、酶活性优化、酶-特定底物对接、蛋白质从头设计等产业任务中得到应用，亦已在真实的生产体系中获得验证。
例如，在与合成生物学龙头企业凯赛生物联合进行的一项关键蛋白质优化项目上，“相对于野生菌，人工智能设计的一个重要酶蛋白结构使菌种产率提高了5倍。”
此外，在一项蛋白质疫苗设计项目中，分子之心借助NewOrigin同时针对蛋白疫苗的稳定性、表达量等进行多目标优化，经动物实验初步验证，疫苗产生中和抗体滴度为已公开专利和相关大型药企蛋白疫苗的数倍，突破相关疫苗稳定性专利。
“按需定制”之外，针对蛋白质动态结合设计这一业内兼具产业价值与突破难度的问题，分子之心也自研了算法。分子之心向36氪介绍：“目前AlphaFold等算法局限于蛋白质静态结构预测，全球范围内尚无公开的成熟方法。我们自研的蛋白动态结合设计算法，能够有效规避目前主流算法和大模型大量存在的假阳性问题。”
据悉，前述NewOrigin大模型及蛋白动态结合算法等能力正在被逐渐集成至MoleculeOS中。未来，该平台将面向生物经济领域不同背景、不同需求的用户，提供API、软件、解决方案、技术服务等多种形式的蛋白质设计工具和服务，通过搭建基础设施平台降低AI蛋白质技术的应用门槛。
除了面向产业发展建设AI生物领域的共性技术平台以外，分子之心也在逐步与医药、材料、化工、食品、农业等领域的头部企业达成深度合作，用AI蛋白质技术突破传统生物方法的局限，设计性能更优的超级酶，并赋能代谢通路设计、工艺优化等生物制造全流程。
